Que el empleado cobre solo los días de alta en la empresa te lo debería hacer la medida. Con esto quiero decir que al ejecutar la medida de baja y limitar los infotipos correspondientes, el empleado debería cobrar solo por el período que trabajó.

Lo que tendrías que ver es como está configurada la medida, si hace que corte los infotipos y ver como tienes parametrizada la alicuotación en el esquema que es la que te hace todo ese tipo de cálculos.

Espero te sirva..

Saludos.